1、地理位置不同

成都市大熊猫基地：四川省成都外北熊猫大道1375号 。

都江堰熊猫乐园：位处市青城山镇石桥村怀中路，距市区18公里，北领道教圣地青城山，南邻川西街子古镇，省道s106（川西旅游环线）连贯其间。

2、建设背景不同

成都市大熊猫基地：

成都大熊猫繁育研究基地是在成都动物园饲养、救治、繁育大熊猫的基础上建立起来的。20世纪80年代，邛崃山系冷箭竹开花枯死，一部分大熊猫因缺食饥饿而被救护集中到成都动物园。1987年，为了加强对病饿大熊猫的救治管理，将大熊猫的教育展示功能与救护研究功能分离，强化大熊猫科学研究，提高大熊猫繁育水平，成都市人民政府决定建立成都大熊猫繁育研究基地。

都江堰熊猫乐园：

在“5.12”汶川特大地震中，中国大熊猫保护研究中心（以下简称“研究中心”）大熊猫圈舍、科研设施、设备等损毁严重。2009年6月19日，经四川省发展和改革委员会立项批复，同意在都江堰市青城山镇石桥村，建设卧龙自然保护区都江堰大熊猫救护与疾病防控中心（现单位名称为中国大熊猫保护研究中心都江堰基地），并纳入香港特区政府资助援建范围。

3、基地分布不同

成都市大熊猫基地：

成都大熊猫繁育研究基地内设机构为5个部，名称分别为：综合秘书部、动物饲养管理部、动物疫病防控部、动物保护研究中心、都江堰野放繁育研究中心。

都江堰熊猫乐园：

熊猫乐园根据不同功能主要划分为疾病防控研究区、检疫隔离区、康复训练区、公众教育区、自然景观区、办公区七个区域，其中康复训练区、公众教育区、自然景观区将全面对公众开放。